總體基因體學（Ｍetagenomics）醫學漫談
張朝翔 藥學博士/藥師
總體基因體醫學是研究以基因體間共生與互動的理論醫學架構，隨著時代的進步，總體基因體醫學也越來越完善。我在美佳胜肽公司時，提出總體基因體醫學的概論，把人體所有細胞當成第一基因體，把人體體內的微生物當做第二基因體，把圍繞人體環境的生物體或會影響第一與第二基因體基因組表現的有機物或無機物，定義為第三基因體。
第一基因體與第二基因體的共同表現叫元基因組，成人的細胞數約37.2兆細胞，寄生與共生在人體的微生物遠高於人體細胞,所以身體其實不只是自己而已。而微生物包括了益生菌或病原菌或伺機菌,病毒,真菌與其它。
1977年薩維奇教授提出的一篇有影響力的評論，認為人體體內的微生物數目為人體細胞的10倍，所以一般在公眾場合與學術論文引用這個比值,因而1:10這比值形象化深植人心。人類基因組大約由2萬個基因組成，但人體中的微生物群的基因大約在200萬到2000萬個之間。而遺傳學家朱利安・塔普根據人體微生物群系的最優勢種，把比值適度地定在30比1。
加州理工學院微生物學家薩爾基斯認為，人類不僅僅有一個基因組，人體中的微生物群應該是我們身體中的第二個基因組,人體生理與健康的表現，是由人體細胞DNA再加上人體中微生物的DNA共同組成,這算是元基因組的由來之一。
而人體的微生物以胃腸道最多微生物在人體中的角色。它們在幫助消化、調節人體免疫功能、保護人體免受疾病攻擊以及生產人體必須的維生素如Ｂ群，扮演著重要角色。
總體基因體醫學的概念，像中國哲學裡的三才，天地人,代表了第三基因體與第二基因體與第一基因體。天之道,損有餘以補不足,與自然醫學的某些概論不謀而合。我認為總體基因體醫學的概念，在於活的基因體之間的和諧性，如果這個和諧或共生生態,短期微幅失去平衡,是可以透過種種手段來修復或者維持（亞健康也是一種維持）。以總體基因組表現的和諧性或正常化，作為整個醫療與健康的結構醫學中心去發散,我認為這個視角是一個非常有趣的醫學與生活健康的態度。後續，我將以自身的研究與體驗與眾多已發表或未發表的國際或國內論文文獻相驗證與思考,人,如何走出自己漫長而能控制的路。
我預計將探討
1.免疫系統失調，如各類型過敏，慢性器官或組織發炎,不同型態之腫瘤等。
2.感染性疾病與症候群：病毒類如流行性感冒，腸病毒，腺病毒等。細菌類，如皮膚或粘膜感染。皮膚領域，如真菌感染，難癒合傷口等。粘膜領域，如口腔，胃，小腸與大腸之消化道感染，泌尿與生殖道感染。呼吸道感染，如鼻腔，咽喉與下呼吸道感染等。
3.中樞神經病變或症候群：如失智症或記憶力退化，躁鬱症，過動症等。
4.代謝性疾病：心血管疾病如動脈硬化，肥胖症與體重管理。
5.周邊神經系統失調：如自律神經失調等
4.內分泌疾患與症候群：如雌性荷爾蒙失調或雄性荷爾蒙失調與糖皮質激素失調等。
6.其他領域：
趨勢醫學